稅收征管中合法有效憑證的管理如下所示：

一、增值稅征管中的合法有效憑證

(一)增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證的-般規(guī)定

根據(jù)《中華人民共和國(guó)增值稅暫行條例》的規(guī)定，準(zhǔn)予從銷(xiāo)項(xiàng)稅額中抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額，除購(gòu)進(jìn)免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品準(zhǔn)予抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額外，僅限于下列增值稅扣稅憑證上注明的增值稅稅額：從銷(xiāo)售方取得的增值稅專(zhuān)用發(fā)票上注明的增值稅稅額；從海關(guān)取得的完稅憑證上注明的增值稅稅額。

(二)增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證的幾項(xiàng)特殊規(guī)定

1.以收購(gòu)憑證作為外購(gòu)農(nóng)業(yè)產(chǎn)品和廢舊物資進(jìn)項(xiàng)稅額的計(jì)算依據(jù)。根據(jù)《增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第十七條的規(guī)定，購(gòu)進(jìn)免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的買(mǎi)價(jià)，僅限于經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)使用的收購(gòu)憑證上注明的價(jià)款。按照規(guī)定，以收購(gòu)憑證上注明價(jià)款按13%計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額方準(zhǔn)予抵扣。但針對(duì)一些農(nóng)業(yè)生產(chǎn)單位銷(xiāo)售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品可以開(kāi)具普通發(fā)票的實(shí)際情況，為簡(jiǎn)化手續(xù)，根據(jù)《關(guān)于增值稅若干征收問(wèn)題的通知》(國(guó)稅發(fā)[1994]122號(hào))規(guī)定，對(duì)一般納稅人購(gòu)進(jìn)農(nóng)業(yè)產(chǎn)品取得的普通發(fā)票，可以按普通發(fā)票上注明的價(jià)款計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。從事廢舊物資經(jīng)營(yíng)的增值稅一般納稅人收購(gòu)的廢舊物資不能取得增值稅專(zhuān)用發(fā)票的，據(jù)經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)使用的收購(gòu)憑證上注明的收購(gòu)金額，依10%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額予以扣除。

2.普通發(fā)票作為運(yùn)輸費(fèi)用準(zhǔn)予抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的計(jì)算依據(jù)。從1994年5月1日起，對(duì)增值稅一般納稅人外購(gòu)貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的運(yùn)輸費(fèi)用,根據(jù)運(yùn)費(fèi)結(jié)算單據(jù)(普通發(fā)票)所列運(yùn)費(fèi)金額依7%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額準(zhǔn)予扣除，但隨同運(yùn)費(fèi)支付的裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等其他雜費(fèi)不得計(jì)入進(jìn)項(xiàng)稅額予以扣除。從2003年11月1日起，提供貨物運(yùn)輸勞務(wù)的納稅人須開(kāi)具貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票，作為記賬憑證和增值稅抵扣憑證。

(三)對(duì)電力銷(xiāo)售、自來(lái)水銷(xiāo)售及商業(yè)零售企業(yè)使用專(zhuān)用發(fā)票的規(guī)定

對(duì)供電部門(mén)銷(xiāo)售電力、自來(lái)水公司銷(xiāo)售自來(lái)水，除銷(xiāo)售給普通消費(fèi)者的以外，均需開(kāi)具專(zhuān)用發(fā)票。對(duì)商業(yè)零售企業(yè)銷(xiāo)售商品凡向購(gòu)買(mǎi)方開(kāi)具專(zhuān)用發(fā)票的，必須按照《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅專(zhuān)用發(fā)票使用問(wèn)題的通知》(國(guó)稅明電[1994]35號(hào))的規(guī)定.在購(gòu)買(mǎi)方提供蓋有一般納稅人戳記的稅務(wù)登記證(副本)的前提下，銷(xiāo)貨方方可開(kāi)具專(zhuān)用發(fā)票。

二、營(yíng)業(yè)稅征管中的合法有效憑證

(一)營(yíng)業(yè)額減除項(xiàng)目憑證

對(duì)營(yíng)業(yè)額減除項(xiàng)目支付款項(xiàng)發(fā)生在境內(nèi)的，該減除項(xiàng)目支付款項(xiàng)憑證必須是發(fā)票或合法有效憑證；支付給境外的，該減除項(xiàng)目支付款項(xiàng)憑證必須是外匯付匯憑證，或外方公司的簽收單據(jù)、出具的公證證明。

(二)聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)憑證

對(duì)自開(kāi)票納稅人開(kāi)展的聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)，以其向貨主收取的運(yùn)費(fèi)及其他價(jià)外收費(fèi)減去付給其他聯(lián)運(yùn)合作方運(yùn)費(fèi)后的余額為營(yíng)業(yè)額計(jì)算征收營(yíng)業(yè)稅。

三、企業(yè)所得稅征管中的合法有效憑證

(一)將企業(yè)提供的完整、準(zhǔn)確的收入及成本、費(fèi)用憑證作為核定征收的重要依據(jù)。不能正確計(jì)算應(yīng)納稅所得額的.稅務(wù)機(jī)關(guān)有權(quán)核定其應(yīng)納稅所得額。

(二)將對(duì)關(guān)聯(lián)企業(yè)憑證的現(xiàn)場(chǎng)審計(jì)作為關(guān)聯(lián)企業(yè)業(yè)務(wù)往來(lái)調(diào)整的依據(jù)之一。在企業(yè)不能提供準(zhǔn)確的價(jià)格、費(fèi)用等憑證資料的情況下，可采取核定利潤(rùn)率及其他合理方法進(jìn)行調(diào)整。

(三)將相關(guān)憑證作為計(jì)算成本的根據(jù)。納稅人在經(jīng)營(yíng)活動(dòng)中發(fā)生的成本劃分為直接成本和間接成本。其中，直接成本可根據(jù)有關(guān)會(huì)計(jì)憑證、記錄直接計(jì)入有關(guān)成本計(jì)算對(duì)象或勞務(wù)的經(jīng)營(yíng)成本中。